Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sil1Q9EPK6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms