Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a3Q9DCP2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a3Q9DCP2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms