Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms