Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufa8Q9DCJ5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufa8Q9DCJ5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms