Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Csnk1dQ9DC28 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1dQ9DC28 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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