Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf6Q9DBU5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms