Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med27Q9DB40 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms