Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp2aQ9DB34 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chmp2aQ9DB34 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms