Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnpy3Q9DAU1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms