Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms