Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Q9D8Q6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Q9D8Q6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Q9D8Q6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Q9D8Q6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Q9D8Q6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Q9D8Q6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8Q6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms