Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms