Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fip1l1Q9D824 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fip1l1Q9D824 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms