Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Cldn22Q9D7U6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn22Q9D7U6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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