Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmigd1Q9D7L8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms