Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttc9bQ9D6E4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttc9bQ9D6E4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttc9bQ9D6E4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttc9bQ9D6E4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ttc9bQ9D6E4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ttc9bQ9D6E4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ttc9bQ9D6E4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ttc9bQ9D6E4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc9bQ9D6E4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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