Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Rab11fip1Q9D620 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Rab11fip1Q9D620 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Rab11fip1Q9D620 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
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Rab11fip1Q9D620 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab11fip1Q9D620 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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