Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
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Ccdc39Q9D5Y1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc39Q9D5Y1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Ccdc39Q9D5Y1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Ccdc39Q9D5Y1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
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Ccdc39Q9D5Y1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Ccdc39Q9D5Y1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ccdc39Q9D5Y1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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