Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam227bQ9D518 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms