Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrp2bpQ9D4C6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms