Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933421I07RikQ9D420 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms