Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx29Q9D3S3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx29Q9D3S3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms