Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd2Q9D3B1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd2Q9D3B1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms