Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rufy3Q9D394 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms