Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig1Q9D2J4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms