Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim42Q9D2H5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms