Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Trappc6bQ9D289 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Trappc6bQ9D289 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Trappc6bQ9D289 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Trappc6bQ9D289 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Trappc6bQ9D289 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Trappc6bQ9D289 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Trappc6bQ9D289 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Trappc6bQ9D289 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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