Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd2Q9D1L0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Chchd2Q9D1L0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Chchd2Q9D1L0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd2Q9D1L0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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