Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Susd3Q9D176 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Susd3Q9D176 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms