Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp11Q9CZJ1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms