Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem39aQ9CYC3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem39aQ9CYC3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms