Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bud23Q9CY21 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms