Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms