Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed5Q9CXE7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms