Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Xrcc3Q9CXE6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Xrcc3Q9CXE6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Xrcc3Q9CXE6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Xrcc3Q9CXE6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Xrcc3Q9CXE6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Xrcc3Q9CXE6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Xrcc3Q9CXE6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Xrcc3Q9CXE6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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