Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Cnot11Q9CWN7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cnot11Q9CWN7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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