Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sycp2Q9CUU3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sycp2Q9CUU3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms