Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms