Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prps2Q9CS42 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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