Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms