Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CQM1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CQM1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQM1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQM1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQM1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQM1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQM1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CQM1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQM1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQM1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQM1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQM1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQM1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQM1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQM1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQM1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQM1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQM1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQM1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQM1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CQM1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CQM1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms