Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znhit3Q9CQK1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms