Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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