Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl39lQ9CQD0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Rpl39lQ9CQD0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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