Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQC3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms