Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ubl4bQ9CQ84 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms