Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkp2Q9CQ73 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms