Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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