Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms