Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim8Q99PJ2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms